Op de CSA worden de gebruikte instrumenten gereinigd, gedesinfecteerd, gecontroleerd, samengesteld, verpakt, geregistreerd, gesteriliseerd en opgeslagen. Om deze taken naar behoren uit te kunnen voeren beschikt de CSA over een speciaal voor dit doel gebouwde afdeling. Deze afdeling bestaat uit diverse zones die fysiek van elkaar zijn gescheiden.
De zones zijn als volgt te onderscheiden:
Desinfectie ruimte, hier komen de gebruikte instrumenten binnen en worden voorbehandeld voor het reinigen en desinfecteren.
Inpak (schone) ruimte, hier worden de instrumenten na het desinfectieproces gecontroleerd, de sets samengesteld, verpakt, geregistreerd en voorbereid voor sterilisatie.
Ontlaad ruimte, hier komen de pakketten terecht na het sterilisatieproces.
Steriele ruimte, hier worden de gesteriliseerde producten opgeslagen.
Uiteraard zijn er ook kleedkamers met toilet en douche, een koffiekamer, kantoorruimte en een opslagruimte voor gebruiksmaterialen aanwezig. In de ruimtes heerst een gecontroleerde luchthiërarchie. dat wil zeggen dat in de ontlaadruimte de hoogste luchtdruk heerst en in de vuile ruimte de laagste. Hierdoor kan er nooit "vuile" lucht naar de schone ruimtes stromen.
De verschillende zones zijn door de medewerkers te betreden via sluizen die er voor zorgen dat de luchtstroming niet wordt verstoord. De instrumenten gaan via de machines naar de volgende ruimte. De medewerkers dragen speciale kleding en dienen zich bij het verlaten van een ruimte om te kleden.
Van de medewerkers wordt een hoge mate van hygiëne verwacht en het is niet toegestaan om horloges en ringen te dragen. Het hoofdhaar en de oren worden bedekt met een muts. In de vuile ruimte dient men beschermende middelen te dragen zoals handschoenen en gezichtsbescherming.
De afdeling is niet zomaar toegankelijk voor bezoekers, deze dienen zich om te kleden.
