In de desinfectieruimte, ook wel vuile ruimte genoemd, begint het proces van reinigen, desinfecteren en steriliseren. In deze ruimte worden de gebruikte instrumenten uit het hele ziekenhuis in transportwagens aangeleverd. In sommige gevallen heeft de CSA een directe verbinding met de OK en dan hoeven de gebruikte instrumenten niet in gesloten wagens te worden getransporteerd.
Na ontvangst worden de instrumenten gesorteerd op reinigingsmethode. Achtergebleven vuil en verpakkingsmateriaal wordt verwijderd. Scharnierende instrumenten zoals scharen en klemmen worden open in de netten gelegd en instrumenten die voor het reinigen gedemonteerd dienen te worden, worden vakkundig en voorzichtig gedemonteerd.
Grof vuil zoals bot en bloedresten wordt van de instrumenten afgespoeld en holle ruimten zoals zuigbuizen worden geborsteld. Onze CSA beschikt over een geautomatiseerd instrumenten-volg systeem. Hier worden de instrumenten voor de eerste keer tijdens deze cyclus geregistreerd.
Instrumenten met scharnieren en holle instrumenten worden in een ultrasoonbad geplaatst. Door middel van hoogfrequente geluidsgolven wordt vuil op de instrumenten los "getrild". Deze behandeling duurt 3 minuten.
Na deze voorbereiding worden de instrumenten die machinaal gereinigd worden in netten (manden) in de wasmachines geplaatst. In de machine worden holle instrumenten aangesloten op een doorspoel systeem. De wasmachines beschikken over speciale programma's die zijn ingesteld op het soort instrumentarium, bijvoorbeeld een programma voor algemeen instrumentarium, een programma voor oogheelkundig instrumentarium en een programma voor MIC (minimaal invasieve chirurgie) programma. Het gekozen programma bepaalt welke proces stappen de machine uitvoert en hoe lang deze stappen duren. Over het algemeen bestaat een programma uit een spoelfase, reinigingsfase, 2e spoelfase, desinfectiefase naspoelfase en droogfase. Wanneer het programma volledig en zonder storingen is verlopen kunnen de schone instrumenten uit de machine worden genomen. De machines worden jaarlijks gevalideerd.
Instrumenten die handmatig worden gereinigd, worden op een speciaal aanrecht gereinigd, gedroogd met perslucht en gedesinfecteerd met alcohol 70%. Na deze behandeling worden de instrumenten d.m.v. een doorgeefluik naar de inpakruimte gestuurd.
Gebruikt transportmateriaal zoals bakken en transportwagens worden machinaal of handmatig gereinigd en gedesinfecteerd voordat deze weer worden gebruikt.
In de desinfectieruimte worden alle instrumenten als besmet beschouwt. Dit betekend dat men er voorzichtig dient te werken en de nodige beschermende middelen gebruikt zoals spatschort, gezichtsbescherming, handschoenen en spatschermen.