De afdeling Klinische Pathologie maakt deel uit van het Medisch Technisch Centrum (MTC) en verricht als zelfstandig opererende afdeling op verzoek van de aanvragers histologische, cytologische en postmortale onderzoeken voor de drie ziekenhuislocaties van het Atrium medisch centrum.
Daarnaast levert de afdeling diagnostiek voor de huisartsen binnen de regio Parkstad, enkele huisartsen binnen de regio Heuvelland, instellingen als Valkenhorst, Welterhof, Afcent, Diagnostisch Centrum Maastricht en zijn er productie afspraken met het IKL in verband met het bevolkingsonderzoek voor baarmoederhalskanker (BVO).
De doelstelling van de afdeling hierbij is om binnen werkbare tijdsgrenzen (2-5 werkdagen) een juiste diagnose te stellen, een optimale verslaglegging hiervan te realiseren en waar noodzakelijk de behandelaar te adviseren over het te volgen behandelplan. Daarnaast beoogt de afdeling een actieve, meedenkende rol te spelen op het gebied van de ontwikkelingen in de diagnostische methoden (flowcytometrie, geneesmiddelen-gevoeligheid van tumoren etc.).