Atrium MC is NIAZ geaccrediteerd. De NIAZ-accredatatie is een soort keurmerk vergelijkbaar met de ISO-certificaten in het bedrijfsleven.

Het NIAZ (Nederlands Instituut voor de Accreditatie van Ziekenhuizen) beslist of een ziekenhuis genoeg doet om de organisatie van de zorg continu te verbeteren. Op 18 augustus 2003 besloot het NIAZ dat Atrium MC dit keurmerk verdient, omdat er een  ‘aantoonbare verbetercultuur’ heerst. Daarmee was Atrium MC het zesde ziekenhuis in Nederland met een NIAZ-accreditatie. Inmiddels heeft de tweede en derde accreditatieronde plaatsgevonden, waarmee het accreditatiebewijs tot accreditatiebewijs tot 2015 verlengd is.

Het voldoen aan de voorwaarden gaat niet vanzelf. In 2000 zijn de afdelingen gestart met het maken van kwaliteitshandboeken. Alle processen zijn onder de loep genomen, beschreven en vastgelegd. Tal van werkgroepen hebben processen op elkaar afgestemd en verbeterd. Dat is overigens een continu proces dat nog altijd speelt. Het blijven voldoen aan de voorwaarden is een enorme operatie waarbij honderden medewerkers en specialisten dagelijks betrokken zijn.